二氧化碳培養箱的選購,主要從主要從溫度、濕度、CO2深度、防污染方面控制.所以一般對這四項的控制要求比較高.
溫度加熱方式一般分水套式（通過夾套水作為加熱介質,重量重、長溫慢,降溫也慢）和氣套式（通過加熱夾套里空氣.加熱快、降溫快）.水套式適合實驗環境不太穩定（如有用電限制或經常停電）的用戶選用,氣套式特別有利于短期培養以及需要箱門頻繁開關取放樣的培養.此外,對于使用者來說氣套式設計比水套式更簡單化（水套式需要對水箱進行加水、清空和清洗,并要經常監控水箱運作的情況,還有潛在的污染隱患）.
CO2濃度可以通過紅外傳感器（IR）或熱導傳感器（TC）進行監測.熱導式技術成熟,易漂移,當需要的培養條件和頻繁開啟培養箱門時,此控制系統就顯得不太適用了.紅外傳感、成本高,應用在進氣口具有HEPA空氣過濾器的培養箱較合適.
如果作為細胞類培養,建議選用進口的,如果細菌類的培養,一般的國產的就可以了.