純培養MAX重要的是在于微生物的生理研究，方法是依靠滅菌和分離。在自然界中，有的培養條件很困難，特別是具有密切共生關系的生物及進行寄生性營養的生物；也有一些在理論上不可能進行純粹培養的生物。那么怎樣獲得純培養微生物呢？下面四種方法告訴您：

        一、單孢子或單細胞分離法

        采取顯微分離法從混雜群體中直接分離單個細胞或單個個體進行培養以獲得純培養，稱為單細胞（單孢子）分離法。單細胞他離法的難度與細胞或個體的大小成反比，較大的微生物如藻類、原生動物較容易，個體較小的細菌則較難。在顯微鏡下使用單孢子分離器進行機械操作，挑取單孢子或單細胞進行培養。也可以采用特制的毛細管在載玻片的瓊脂涂層上選取單孢子并切割下來，然后移到合適的培養基進行培養。單細胞分離法對操作技術有比較高的要求，多限于高度專業化的科學研究中采用。

        二、利用選擇性培養基分離法
        各種微生物對不同的化學試劑、染料、抗生素等具有不同的抵抗能力，利用這些特性可配制合適某種微生物而限制其它微生物生長的選擇培養基，用它來培養微生物以獲得純培養。
        另外，還可以將樣品預處理，消除不希望分離到的微生物。如加溫殺死營養菌體而保留芽孢，過濾去除絲狀菌體而保留單孢子。
        三、平板劃線分離法
        有接種環以菌操作沾取少許待分離的材料，在無菌平板表面進行平行劃線、扇形劃線或其他形式的連續劃線，微生物細胞數量將隨著劃線次數的增加而減少，并逐步分散開來，如果劃線適宜的話，微生物能一一分散，經培養后，可在平板表面得到單菌落。
        四、稀釋倒平板法
        先將待分離的材料用無菌水作一系列的稀釋（如 1 ∶ 10 、 1 ∶ 100 、 1 ∶ 1000 、 1 ∶ 10000 …），然后分別取不同稀釋液少許，與已溶化并冷卻至 45 ℃左右的瓊脂培養基混合，搖勻后，傾入滅過菌的培養皿中，待瓊脂凝固后，制成可能含菌的瓊脂平板，電熱恒溫培養箱保溫培養一定時間即可出出菌落。如果稀釋得當，在平板表面或瓊脂培養基中就可出現分散的單個菌落，這個菌落可能就是由一個細菌細胞繁殖形成的。隨后挑取該單個菌落，或重復以上操作數次，便可得到純培養。